Departamenti i Mikrobiologjisë ka një në diagnostikimin, monitorimin dhe studimin e mikroorganizmave që ndikojnë në shëndetin e njeriut.
Disa nga përgjegjësitë kyçe të këtij departamenti përfshijnë:
Dr. Arsim Kurti, Udhëheqës I Departamentit
E-mail: Arsim.Kurti@rks-gov.net